Cancelaria Eparhială este centrul administrativ al Arhiepiscopiei Chișinăului, unde se gestionează corespondența oficială, documentele și relația cu clerul și credincioșii. Activitatea este coordonată de secretarii responsabili ai Cabinetului Mitropolitan, ai Cabinetului Episcopului Vicar și ai Secretariatului Eparhial.